“十一五”期间，市农科院先后主持育成小麦、大豆、玉米、棉花等农作物16个新品种，其中国审农作物品种6个。特别是近两年，周口市农科院通过国家审定的小麦新品种周麦22号、周麦23号和省审周麦24号亩产均超过740公斤，在全国居领先水平。周麦系列小麦品种年推广面积约占河南省小麦种植面积的20%左右，年增社会经济效益10亿元左右。市农科院还积极适应改革开放的新形势，从农业和农村经济发展的实际需要出发，坚持自主科技创新,推动科技成果转化，科研水平和科技成果转化率均居全省同级农业科研单位前列。

　　自主科技创新工作成绩突出。市农科院始终坚持把科技创新作为立院之本，紧紧围绕农业发展急需的重大关键技术，组织力量加强攻关，确保推出高水平的科研成果。“十一五”期间，先后主持育成小麦、大豆、玉米、棉花等农作物16个新品种，为我省、我市下一次小麦品种更新换代和粮食核心区建设提供了技术保障。 “豫玉29号玉米杂交种选育及产业化”于2006年获省科技进步二等奖，“高产、早熟、大果、耐涝花生新品种周花2号选育与应用”和“夏花生高产、高效规范栽培技术研究与应用”分别于2008年、2009年获市科技成果一等奖；有6个作物新品种获国家植物新品种权保护。

　　加速科技成果产业化转化进程。一是在新品种推广方面，走科企联合之路，周口市农科院与河南天存种业科技有限公司合作，通过新品种种子繁育基地建设和成果示范基地建设，发挥辐射带动作用，推进农业结构调整和产业化，周麦系列小麦品种年推广面积约占河南省小麦种植面积的20%左右，年增社会经济效益10亿元左右。二是农作物专用复合肥以周口市农科院科技开发公司为主，探索研制、生产和推广一体化的路子。几年来,生产作物专用复合肥十几万吨。三是食用菌生产能力进一步提高。年引进和推广优质菌种10万余瓶（袋），销售量稳中有升。

　　加强项目建设，科技创新条件明显改善。“十一五”期间，周口市农科院先后承担省和国家各类科研项目10项，国家产业技术体系综合试验站项目3个（小麦、大豆、芝麻），同时还承担着国家和省级区域试验、生产试验课题30多项。通过实施项目带动，市农科院的科研条件和基础设施进一步改善。