清咸丰三年(1853年)至十年(1860年),捻军首领赖文光、张宗禹等率部4次攻占周家口,致使商贸繁荣、航运发达、经济鼎盛一时的周家口商埠陷入战火之中。
同治四年(1865年),两江总督曾国藩为镇压捻军,以安徽临淮、山东济宁、河南周家口、江苏徐州为老营,各驻重兵,多储粮草,三省往援。四镇之中以周家口三川交汇、河道纵横、地处要冲,防务最为紧要。其部下淮军名将刘铭传足智多谋,兵强马壮,因此,曾国藩命刘铭传军驻扎周家口。刘铭传在周家口多次堵截捻军,十月二十日,与赖文光率领的捻军激战于沈丘,并大败捻军。
同治五年(1866年)正月,曾国藩由济宁登舟察看河道防务,进驻周家口,行辕设在周家口覃怀会馆(又名四圣会馆,今盘纸厂),指挥“剿捻”。是年,驻扎周家口淮军将领张树珊率部与捻军激战于苑寨,后追击至湖北德安府新家闸,于激战中战死。曾国藩为其奏请封赏,在周家口南寨胡家集(今省越调剧团院内)为张树珊立祠,群众称为张家祠堂(即张公祠)。十一月二十六日,清廷以曾国藩“剿捻”无功,命淮系李鸿章代司其职,专办“剿捻”事宜。
同治六年(1867年)二月,曾国藩由周家口启行,前往徐州。至此,曾国藩驻军周家口督办“剿捻”军务时有一年有余。