３０年来，商水县疾病预防控制中心作为疾病预防控制和卫生监督检测中心，以保障全县人民群众身体健康为己任，在全县传染病的预防控制和卫生监督监测中取得了卓有成效的成绩，为全县的疾病预防控制及卫生监督检测工作积累了丰富的经验。

　　基本建设

　　办公用房：商水县疾病预防控制中心（原防疫站）１９７８年仅有办公用房２０余间，建筑面积为４８０平方米。后于１９８３年建办公楼１栋，建筑面积为１４８２平方米。２００４动工筹建建筑面积为２２０９平方米的疾病控制大楼１栋，当年１２月底正式投入使用。目前，该中心办公用房为３７７２平方米。

　　检验室建设：商水县投资近４０万元对中心实验室进行了全面整改，创建了全市一流的检测中心。中心实验室拥有大型仪器设备：微波消解仪、纯水处理器等近１０台，中小型仪器１５台，又装备了万级无菌室、局百级无菌室。

　　重点传染病防治

　　消灭脊灰，强化免疫：商水县从１９９２起对全县范围内０～３岁儿童每年两次强化服苗，每次服苗前采取多种形式进行大力宣传，达到家喻户晓，让人们明白脊灰的危害、预防及强化服苗的重大意义。

　　乙肝疫苗普种：商水县是乙肝的高发县，全县乙肝病毒携带者约有１０万人，全县统一布置，积极行动，于１９９９年１２月底完成接种工作，当年，全县共接种乙肝疫苗１０２４２６人。

　　甲肝普种：该县以１～１５岁青少年儿童及社会高危人群为重点的甲肝疫苗接种率超过８０％，初步构成全县的甲肝免疫屏障。

　　艾滋病预防：２００３年，商水县被定为艾滋病防治示范区。２００５年４月，根据上级要求，该县成立了ＨＩＶ检测实验室，通过实施艾滋病综合防治和救治，目前疫情得到了有效控制。

　　结核病防治：２００５年１月１日，“中国结核病控制项目”在该县启动，完善了县、乡、村三级防痨网络。２００７年，全球基金第五轮结核病项目在该县启动，经免费抗结核治疗后，治愈率达到９２％。

　　地方病、寄生虫防治工作

　　地方性氟中毒：２００４年，全县进行氟水监测工作，现基本控制了本病的发生流行。

　　丝虫病：１９８４年１２月，该县已通过省级考核验收，达到国家规定基本消灭丝虫病的标准。２００３年，该县丝虫病防治工作顺利通过周口市对消灭丝虫病的审评，并通过河南省消灭丝虫病复审。２００４年７月，该县通过了卫生部的考核验收，已达到了部颁消灭丝虫病的标准。